Netbeans permet de se connecter à n'importe quel moteur SQL au travers de driver JDBC, ceci vous permet par exemple de générer du code directement en fonction du contenu de votre base SQL.

Télécharger mysql connector, dans l'archive vous trouverez le fichier: mysql-connector-java-5.0.4-bin.jar, le conserver pour la suite.

Dans Netbeans, cliquer sur l'onglet Runtime, puis le menu déroulant Database, bouton droit sur Drivers, New Driver

Indiquer le chemin de mysql-connector précédemment téléchargé.

Valider par OK, une fois le driver ajouté MySQL apparait dans la liste des drivers disponibles.
Bouton droit, sur le connector Mysql|Connect using

Remplir le champs Database URL comme indiqué jdbc:mysql://<HOST>:<PORT>/<DB>
remplacer HOST par localhost si votre Mysql tourne sur la même machine, le port par défaut est 3306.
Entrer enfin le login et mot de passe d'accès à votre database.
jdbc://mysql est apparu dans le menu, vous pouvez maintenant accéder au données, créez de nouvelles tables ....